Die Operation bei einem nicht infizierten Atherom gestaltet sich in der Regel unauffällig, mit schweren Komplikationen ist nicht zu rechnen.
Verbleiben Teile der Kapsel oder des Talgdrüsenganges, kommt es zum Wiederauftreten ("Rezidiv").
Schwellungen im OP-Bereich, bedingt durch Blutergüsse oder Gewebewasseransammlungen, sind möglich. In aller Regel verschwinden diese Schwellungen in kurzer Zeit.
Auch leichte Schmerzen im OP-Gebiet oder Gefühlstörungen werden beobachtet. Die Schmerzen lassen bald nach, die Gefühlstörungen, die häufig nur einen kleinen Hautbereich betreffen, können jedoch auch länger anhalten oder auf Dauer bestehen bleiben.
Infektionen des OP-Gebietes treten bei sorgfältiger Wundbehandlung äußerst selten auf.