Beim Atherom treten Beschwerden erst im fortgeschrittenem Stadium auf. Der Patient kommt meist wegen kosmetischer Gründe zum Arzt. Der Grützbeutel kann jedoch, abhängig von der Lokalisation, auch zu einem unangenehmen Spannungsgefühl führen.
Ein Problem kann eine nicht so seltene Infektion des Atherom sein. Der Knoten wird rot und schmerzhaft, die Umgebung ist druckempfindlich und eventuell fließt Eiter und Talk aus dem Knoten.